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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
22/09/2023 |
Actualizado : |
22/09/2023 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BERAIS-RUBIO, A.; MOREL-REVETRIA, M.; FILIPPI, C.V.; REYNO, R.; MONZA, J. |
Afiliación : |
ANDRÉS BERAIS-RUBIO, Departamento de Biología Vegetal, Laboratorio de Bioquímica, Universidad de la República, Av. Garzón 809, Montevideo PC 12.900, Uruguay; MARÍA MOREL-REVETRIA, Laboratorio de Microbiología de Suelos (LMS), Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Iguá 4225, Montevideo PC 11.400, Uruguay; CARLA VALERIA FILIPPI, Departamento de Biología Vegetal, Laboratorio de Bioquímica, Universidad de la República, Av. Garzón 809, Montevideo PC 12.900, Uruguay; RAFAEL ALEJANDRO REYNO PODESTA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; JORGE MONZA, Departamento de Biología Vegetal, Laboratorio de Bioquímica, Universidad de la República, Av. Garzón 809, Montevideo PC 12.900, Uruguay. |
Título : |
Ensifer meliloti elite strain U143 used as alfalfa inoculant in Uruguay: Characterization and draft genome sequence. |
Fecha de publicación : |
2023 |
Fuente / Imprenta : |
The Microbe. 2023, Volume 1, article 100008. https://doi.org/10.1016/j.microb.2023.100008 -- OPEN ACCESS. |
ISSN : |
2950-1946 |
DOI : |
10.1016/j.microb.2023.100008 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received 23 May 2023, Revised 14 August 2023, Accepted 12 September 2023, Available online 13 September 2023, Version of Record 19 September 2023. -- Correspondence: Jorge Monza, mail: jmonza@fagro.edu.uy -- LICENSE: This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/bync-nd/4.0/). -- FUNDING: This work was financially supported by Instituto Nacional de
Investigación Agropecuaria (INIA) L-1, Grant Comisión Académica de Postgrado, Universidad de la República, Programa de Desarrollo de
Ciencias Básicas (PEDECIBA) and Sistema Nacional de Investigadores (SNI). |
Contenido : |
ABSTRACT.- Ensifer (syn. Sinorhizobium) meliloti U143 is an effective nitrogen-fixing strain isolated from Uruguayan soils. For decades, this strain has been used as an inoculant for different alfalfa cultivars. Here we report for the first time a characterization of the U143 elite strain that includes the preliminary genomic sequence, its annotation, and physiological parameters related to its symbiotic efficiency and nitrate respiration capacity. Through Illumina sequencing, the genome of the U143 strain was sequenced. The genome length was 6,801,966 bp, and it contained two megaplasmids, an average GC content of 62.15 %, and 6522 protein-coding sequences. In the symbiotic plasmid, we identified nap, nir, nor, and nos sequences that explain the ability of the U143 strain to respire NO3- in free-living and microaerobic conditions. Field assays performed in two locations for two years showed that alfalfa inoculated with the U143 strain produced 41 % more total shoot dry matter than the non-inoculated control, and between 61.3 % and 66.5 % of shoot N in alfalfa inoculated with strain U143 derived from nitrogen fixation. © 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd |
Palabras claves : |
Draft genome; Elite strain; Inoculant. |
Asunto categoría : |
A50 Investigación agraria |
URL : |
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2950194623000080/pdf
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Marc : |
LEADER 02580naa a2200241 a 4500 001 1064314 005 2023-09-22 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a2950-1946 024 7 $a10.1016/j.microb.2023.100008$2DOI 100 1 $aBERAIS-RUBIO, A. 245 $aEnsifer meliloti elite strain U143 used as alfalfa inoculant in Uruguay$bCharacterization and draft genome sequence.$h[electronic resource] 260 $c2023 500 $aArticle history: Received 23 May 2023, Revised 14 August 2023, Accepted 12 September 2023, Available online 13 September 2023, Version of Record 19 September 2023. -- Correspondence: Jorge Monza, mail: jmonza@fagro.edu.uy -- LICENSE: This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/bync-nd/4.0/). -- FUNDING: This work was financially supported by Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA) L-1, Grant Comisión Académica de Postgrado, Universidad de la República, Programa de Desarrollo de Ciencias Básicas (PEDECIBA) and Sistema Nacional de Investigadores (SNI). 520 $aABSTRACT.- Ensifer (syn. Sinorhizobium) meliloti U143 is an effective nitrogen-fixing strain isolated from Uruguayan soils. For decades, this strain has been used as an inoculant for different alfalfa cultivars. Here we report for the first time a characterization of the U143 elite strain that includes the preliminary genomic sequence, its annotation, and physiological parameters related to its symbiotic efficiency and nitrate respiration capacity. Through Illumina sequencing, the genome of the U143 strain was sequenced. The genome length was 6,801,966 bp, and it contained two megaplasmids, an average GC content of 62.15 %, and 6522 protein-coding sequences. In the symbiotic plasmid, we identified nap, nir, nor, and nos sequences that explain the ability of the U143 strain to respire NO3- in free-living and microaerobic conditions. Field assays performed in two locations for two years showed that alfalfa inoculated with the U143 strain produced 41 % more total shoot dry matter than the non-inoculated control, and between 61.3 % and 66.5 % of shoot N in alfalfa inoculated with strain U143 derived from nitrogen fixation. © 2023 The Authors. Published by Elsevier Ltd 653 $aDraft genome 653 $aElite strain 653 $aInoculant 700 1 $aMOREL-REVETRIA, M. 700 1 $aFILIPPI, C.V. 700 1 $aREYNO, R. 700 1 $aMONZA, J. 773 $tThe Microbe. 2023, Volume 1, article 100008. https://doi.org/10.1016/j.microb.2023.100008 -- OPEN ACCESS.
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha actual : |
29/08/2019 |
Actualizado : |
29/08/2019 |
Tipo de producción científica : |
Abstracts/Resúmenes |
Autor : |
LLANES-ÁLVAREZ, Y.; HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L.; INÉS PEÑA BÁRZAGA; VICTORIA ZAMORA RODRÍGUEZ; PAREDES TOMAS, C.; RIVAS, F.; LÁZARO MIERES, S.; MEJÍAS, K.; TEJEDA, C.G. DE; MANZANO ALFONOS, L.; HERNÁNDEZ MACHADO, D. |
Afiliación : |
YILIAN LLANES ALVAREZ, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; LESTER HERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; PEÑA BÁRZAGA, I., Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; ZAMORA RODRÍGUEZ, V., Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; CAMILO PAREDES TOMAS, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SERGIO LÁZARO MIERES, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; KRISTOFFER MEJIAS, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; CLAUDIA GREGORIO DE TEJEDA, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; LISET MANZANO ALFONSO, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba.; DIANET HERNÁNDEZ MACHADO, Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT), Cuba. |
Título : |
Incidencia de Citrus tristeza virus (CTV) en áreas citrícolas de Cuba y caracterización parcial de aislados virales. [Incidence of Citrus tristeza virus (CTV) in citrus areas of Cuba and partial characterization of viral isolates.]. FVTO-20. |
Complemento del título : |
Sección científica: Vigilancia fitosanitaria y manejo de plagas. [Scientific sesion: Phytosanitary surveillance and pest management]. |
Fecha de publicación : |
2017 |
Fuente / Imprenta : |
In: Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT). Simposio Internacional de Fruticultura Tropical y Subtropical, 5.; Simposio Internacional de Piña, 9., "Fruticultura 2017". Libro de resúmenes."Por una fruticultura competitiva y sostenible". Cuba: Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical. |
Páginas : |
p. 37-39. |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
RESUMEN.
Citrus tristeza virus (CTV) es el patógeno de origen viral que causa más pérdidas económicas al cultivo de los cítricos. En Cuba, los cambios tecnológicos introducidos en la citricultura como consecuencia de la detección de huanglongbing de los cítricos (HLB), pudieran influir sobre la incidencia de la enfermedad y la composición de los genotipos en las poblaciones de aislados del virus.
ABSTRACT.
Citrus tristeza virus (CTV) is the pathogen of viral origin that causes more economic losses to the cultivation of citrus. In Cuba, the technological changes introduced in citriculture as a consequence of the detection of citrus huanglongbing (HLB), could influence the disease incidence and the genotypes composition in populations of virus isolates. |
Palabras claves : |
CARACTERIZACÓN; CHARACTERIZATION; INCIDENCE; INCIDENCIA. |
Thesagro : |
CTIRUS TRISTEZA VIRUS. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/13166/1/FVTO-20.-Rivas-2017.pdf
|
Marc : |
LEADER 02107nam a2200301 a 4500 001 1060064 005 2019-08-29 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLLANES-ÁLVAREZ, Y. 245 $aIncidencia de Citrus tristeza virus (CTV) en áreas citrícolas de Cuba y caracterización parcial de aislados virales. [Incidence of Citrus tristeza virus (CTV) in citrus areas of Cuba and partial characterization of viral isolates.]. FVTO-20.$h[electronic resource] 260 $aIn: Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical (IIFT). Simposio Internacional de Fruticultura Tropical y Subtropical, 5.; Simposio Internacional de Piña, 9., "Fruticultura 2017". Libro de resúmenes."Por una fruticultura competitiva y sostenible". Cuba: Instituto de Investigaciones en Fruticultura Tropical.$c2017 300 $ap. 37-39. 520 $aRESUMEN. Citrus tristeza virus (CTV) es el patógeno de origen viral que causa más pérdidas económicas al cultivo de los cítricos. En Cuba, los cambios tecnológicos introducidos en la citricultura como consecuencia de la detección de huanglongbing de los cítricos (HLB), pudieran influir sobre la incidencia de la enfermedad y la composición de los genotipos en las poblaciones de aislados del virus. ABSTRACT. Citrus tristeza virus (CTV) is the pathogen of viral origin that causes more economic losses to the cultivation of citrus. In Cuba, the technological changes introduced in citriculture as a consequence of the detection of citrus huanglongbing (HLB), could influence the disease incidence and the genotypes composition in populations of virus isolates. 650 $aCTIRUS TRISTEZA VIRUS 653 $aCARACTERIZACÓN 653 $aCHARACTERIZATION 653 $aINCIDENCE 653 $aINCIDENCIA 700 1 $aHERNÁNDEZ-RODRÍGUEZ, L. 700 1 $aINÉS PEÑA BÁRZAGA 700 1 $aVICTORIA ZAMORA RODRÍGUEZ 700 1 $aPAREDES TOMAS, C. 700 1 $aRIVAS, F. 700 1 $aLÁZARO MIERES, S. 700 1 $aMEJÍAS, K. 700 1 $aTEJEDA, C.G. DE 700 1 $aMANZANO ALFONOS, L. 700 1 $aHERNÁNDEZ MACHADO, D.
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